Une présentation générales des lacs (naissance, fonctionnement, statistiques...) qui introduit les fiches signalétiques des lacs du bassin (Franche-Comté, Rhône Alpes).
Suivi des massesd'eaux souterraines ainsi que la politique de gestion des eaux souterraines.
La présentation des zones humides et leur politique de gestion font le lien avec le premier inventaire du bassin (tourbières, marais, étangs, plaines alluviales).
Présentation des poissons d'eau douce ainsi que des poissons migrateurs amphihalins accompagnée d'une fiche descriptive de chaque espèce rencontrée dans les rivières et plans d'eau du bassin.
